1. जल का क्लोरीनीकरण खतरनाक हो सकता है। 2. तरल वेस्ट का क्लोरीनीकरण कर विसर्जित कर दिया जाता है। 3. दूध और पीने के पानी का क्लोरीनीकरण की निर्जीवाणुकरण जीव नष्ट. 4. क्लोरीनीकरण की तुलना में ओज़ोनीकरण में कम कीटाणुशोधन उपोत्पाद उत्पन्न होते हैं.5. जल मृदुकरण, जल निस्पंदन उपकरण, आयरन निस्पंदन, जल स्वाद और गंध निस्पंदन, क्लोरीनीकरण सिस्टम, नलसाजी मरम्मत, प्रतिस्थापन, 6. एक परजीवी दस्त का उत्पादन है कि दूषित पानी से फैल रहा है क्योंकि यह क्लोरीनीकरण जीवित रह सकते है. 7. अवशिष क्लोरीन या क्लोरमीन में प्राकृतिक जलीय वातावरण में कार्बनिक पदार्थों का क्लोरीनीकरण करने की क्षमता भी हो सकती है. 8. यह तकनीक परजीवियो, रसौली और कृमियों को दूर नहीं करती है और इन्हें क्लोरीनीकरण से भी नहीं मारा जा सकता है। 9. स्वचालित क्लोरीनीकरण प्रणाली को सक्रिय रखने के लिये पूल को हर दिन एक से दो घंटे के लिये फ़िल्टर किया जाना चाहिए. 10. स्वचालित क्लोरीनीकरण प्रणाली को सक्रिय रखने के लिये पूल को हर दिन एक से दो घंटे के लिये फ़िल्टर किया जाना चाहिए.
